组织芯片完全适用于免疫荧光检测，且是其高通量分析的理想平台。由于TMA将数百个组织芯点集成于一张玻片上，能实现一次性批量检测，极大节省了珍贵的抗体与时间。技术操作上，其流程与常规切片基本一致，均需经过脱蜡、抗原修复、封闭、一抗孵育及荧光二抗标记。关键区别在于，必须根据TMA阵列尺寸选择足够大的盖玻片或使用专用的防蒸发孵育盒，确保所有芯点均匀接触试剂。需特别注意的是，石蜡包埋组织因自发荧光较强，实验设计时必须设置严格的阴性对照以区分特异性信号。此外，建议使用防荧光淬灭封片剂进行封片，并尽快扫描，以获取高质量的多重标记图像。
