组织芯片所需的样本例数并无固定值，其核心取决于具体的研究目的和统计学设计。若用于肿瘤标志物的预后分析，通常需要至少 100 至 300 例包含完整随访信息的样本，以确保足够的统计效能检测出生存差异。对于单纯的描述性或初筛性研究，几十例样本可能已能满足需求。
关键在于遵循“样本量计算”原则，需预先设定研究的效应量、显著性水平及把握度。此外，必须充分考虑组织芯片制备及染色过程中的损耗率，通常建议在计算出的理论样本量基础上增加 15% 至 20% 的冗余，以防因组织芯点脱片或信息不全导致有效例数不足，从而保证最终分析结果的可靠性。
