组织芯片的原理，本质上是将传统“一对多”的切片分析模式，革新为“多对一”的高通量阵列。其核心技术流程，是借助精密的组织微阵列仪，用空心取样针从数百个不同供体蜡块（称为“供体蜡块”）的特定区域钻取微小的圆柱形组织芯（直径通常为0.6-2.0毫米），然后将这些组织芯以高密度、阵列化方式精确地重新包埋入一个新的空白受体蜡块中。这一过程构建了一个包含数百个微型组织样本的新蜡块，经切片后可在一张玻片上同时呈现大量组织形态。其根本原理在于通过空间上的精准重组与微型化，实现了在同一实验条件下对海量样本进行同步的原位分析，极大地提高了研究效率并保证了实验条件的一致性。
