组织芯片的核心原理，是将“高通量”与“微型化”理念引入传统病理学。它利用精密的微阵列制作仪，从数百个供体蜡块（即“组织库”）中钻取直径仅零点几毫米的微小组织芯柱，并以极高的精度依序整齐排列，重新包埋入一个新的受体蜡块中。这一过程将原本分散在大量切片上的组织信息，浓缩至一张载玻片上。
其确保结果可比性的关键在于实验条件的绝对均一。所有排列在一起的组织芯柱共享同一张切片，这意味着在后续的免疫组化、原位杂交等检测中，所有样本的试剂孵育时间、浓度、温度及抗原修复等关键步骤完全一致，从根本上消除了批次间差异，保证了结果分析的标准化与可靠性。
