在构建组织芯片时，避开坏死组织是保证芯片质量和后续分析结果准确性的核心前提。坏死组织内的细胞核已发生固缩、碎裂或溶解，其 DNA 和 RNA 等核酸物质已严重降解，蛋白质也发生变性或渗漏。若将这些区域纳入芯片，在后续的免疫组化或原位杂交检测中，会因缺乏有效的分子靶标而出现假阴性结果，或因非特异性吸附产生不可靠的染色信号。此外，坏死区组织结构崩解，失去了可供判读的细胞形态学基础，在扫描分析时无法进行有效的细胞分割与量化。因此，病理医生在镜下定位供体蜡块时，必须精准圈定富含活性肿瘤细胞或目标病变细胞的区域，而将坏死、大量出血及纤维化区域排除在外，以保障组织芯片的“有效信息密度”。
