组织芯片（TMA）与基因芯片的核心区别在于检测对象和通量维度。组织芯片是一种“样本高通量”技术，它将数百个微小组织芯点排列在同一受体蜡块上，主要用于在组织形态学层面同时检测特定蛋白（通过免疫组化）或基因（通过原位杂交）在大量病例中的原位表达情况。而基因芯片是一种“靶标高通量”技术，它从组织样本中提取核酸进行杂交，一次性检测成千上万个基因的表达水平或基因型，但失去了组织形态学背景。简言之，组织芯片是“多人查单项”，侧重蛋白质的原位验证与临床病理统计；基因芯片是“一人查多项”，侧重核酸层面的全景式筛选。
