石蜡组织芯片与冰冻组织芯片在样本处理与核心应用场景上有何本质差异?

石蜡组织芯片（FFPE-TMA）采用福尔马林固定、石蜡包埋，组织形态保存极佳，抗原稳定性高，可长期室温存档。其流程耐受高温抗原修复，特别适合回顾性临床队列的大规模免疫组化（IHC）与DNA原位杂交分析。然而，FFPE过程会严重破坏RNA完整性，且导致部分抗原表位被交联遮蔽。

冰冻组织芯片（Frozen-TMA）将新鲜组织速冻后包埋于OCT介质，省去了固定与脱水步骤，能最大限度保留蛋白质的天然构象与酶活性，尤其完美保存了RNA的完整性，是免疫荧光和RNA原位杂交检测的金标准。其代价是组织形态常出现冰晶空隙，且芯片需要-80°C深低温保存，切片与长期储存的技术门槛和成本均远高于石蜡芯片。