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组织芯片(TMA) 样本前处理怎么做?标准 SOP 一次性讲清

稳定可靠的组织芯片TMA)数据,

始于高标准 FFPE 样本前处理。

固定、脱水、蜡块保存、HE 定位、打孔规格……

一步不规范,

IHC、Nanostring DSP 等后续检测全受牵连。

收好这份实操指南,

让你的TMA 一次成功,不返工!

目的

规范组织芯片(Tissue Microarray, TMA)送样指南,保证阵列位点完整、组织形态完好、抗原保存稳定,适用于后续 IHC、IF、PLA、原位杂交Nanostring DSP等实验。

适用范围

临床手术标本、动物组织福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本的组织芯片制备。、

组织固定要求

组织离体与修剪规范

组织离体至固定的时间间隔不得超过 30 分钟,需尽快完成固定。

组织修剪标准尺寸:

1 cm×1 cm×0.2~0.3 cm;

最大允许尺寸:

1.5 cm×1.5 cm×0.3 cm;

!

组织厚度严格控制在1 mm~3 mm。

组织过厚 

固定与脱水不充分,影响后续切片质量。

组织过薄 

易出现脱水与浸蜡过度、组织脆性增加,打孔取芯时易碎裂、打穿,修块与切片过程中易发生靶组织缺失、位点空洞。

肿瘤样本取材规范

肿瘤样本需同时包含癌组织区域、癌旁正常组织区域、交界区域;

取材时避开大片坏死、出血、钙化区域,剔除缝线、异物、严重脂肪空泡及挤压撕裂组织;

组织切面保持平整,避免褶皱、卷曲、挤压及撕裂损伤。

固定液选择与体积要求

推荐使用10% 中性福尔马林(10% NBF)

 或4% 多聚甲醛(4% PFA);

其中10% NBF 固定穿透力更强,4% PFA

穿透力相对较弱;

固定液体积应为组织块体积的10~20 倍,

保证组织充分固定。

固定时间控制

固定时间依据组织块大小调整,直径 0.5 cm 组织块固定时间为 18~24 小时;

固定时间不得超过 48 小时,超时将导致抗原遮蔽、RNA 降解,影响下游实验。

FFPE 蜡块要求

——如果送的样本为蜡块样本

组织固定

需符合「三」中的要求;

存放条件

蜡块放入干燥器中,保持干燥环境,室温保存;

蜡块年龄

小于 3 年的蜡块 Nanostring 做过实验验证没有问题,3-10 年的蜡块Nanostring 项目做过类似服务可以得到比较理想结果,超过 10 年的蜡块需要客户自行验证蛋白与RNA 的完整性。

蜡块质量

石蜡致密无空洞、无裂纹、无发白粉化。组织与蜡结合紧密,无脱裂、无空鼓。蜡块表面平整,无凹陷、无溢蜡过厚。

HE复诊

做 TMA 前必须先切 HE 片染色:定位靶点、确认组织结构完好,再上机打孔。

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每例供体蜡块常规切片、裱片、HE 染色。

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病理镜下或扫描成像确认:癌区、癌旁、

正常组织、病变靶点位置。

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用记号笔在蜡块表面精准圈定目标取材区域,避开坏死、钙化、出血区。

组织芯片排布 & 打孔常用规格

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常用孔径:1.0 mm / 1.5 mm / 2.0 mm;

2.0 mm直径,5行*13列--65芯

——大病灶、需更多细胞量

1.5mm直径,8行*18列--144芯

——最通用、常规临床样本首选

1.0mm直径,10行*22列--220芯

——微小病灶、穿刺标本、小动物组织、样本数量多阵列

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每例建议至少2~3 个复孔,减少位点缺失,满足统计学要求。

Nanostring DSP 专属规格

——贴片区域是35.3mm*14.1mm

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2.0 mm直径,5行*13列--65芯

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1.5mm直径,6行*17列--102芯

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1.0mm直径,8行*20列--160芯

送样要求

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样本类型

运输方式

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组织样本

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放固定液后即可寄出(不需要

等固定完再送),常温运输

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石蜡组织块

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常温干燥避光运输,防震打包

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石蜡组织切片

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密封干燥,加冰袋,4℃冷藏

运输,防震打包

注意事项

新鲜组织固定超时 / 固定液不对 → 抗原报废;

蜡块粉化、开裂、组织空鼓 → 打孔掉芯、脱片;

没有先 HE 复诊就直接打孔 → 打不到病灶、

位点无效;

组织过厚 / 过薄 → 脱水不佳、阵列高低不平

老旧多年蜡块强行做 TMA → 染色普遍无信号、

背景极高;

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上海乐备实生物技术有限公司(简称:乐备实/LabEx,为优宁维旗下全资子公司),是国内主要专注于提供蛋白检测分析的实验服务专家,目前已扩展到单细胞测序、空间多组学、流式检测、电化学发光、Luminex多因子检测、抗体芯片、PCR Array、ELISA、Elispot、多色免疫组化、PLA蛋白互作30+个技术平台。已经为超过3000+客户单位提供服务,累积检测样本超过100万,受到了广大客户的赞赏。

 

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